激光共聚焦顯微鏡是在熒光顯微鏡成像基礎上加裝了激光掃描裝置，利用計算機進行圖像處理，把光學成像的分辨率提高了30%--40%，使用紫外或可見光激發熒光探針，從而得到細胞或組織內部微細結構的熒光圖像，在亞細胞水平上觀察諸如Ca2+ 、PH值，膜電位等生理信號及細胞形態的變化，成為形態學，分子生物學，神經科學，藥理學，遺傳學等領域中新一代強有力的研究工具。
 

　　激光共聚焦顯微鏡在各個行業的具體應用：
 

　　細胞形態學分析(觀察細胞或組織內部微細結構，如：細胞內線粒體、內質網、高爾基體、微管、微絲、細胞橋、染色體等亞細胞結構的形態特征；半定量免疫熒光分析)；熒光原位雜交研究；基因定位研究及三維重建分析。
 

　　1.細胞生物學：細胞結構、細胞骨架、細胞膜結構、流動性、受體、細胞器結構和分布變化；
 

　　2.生物化學：酶、核酸、FISH(熒光原位雜交)、受體分析；
 

　　3.藥理學：藥物對細胞的作用及其動力學；
 

　　4.生理學：膜受體、離子通道、細胞內離子含量、分布、動態；
 

　　5.神經生物學：神經細胞結構、神經遞質的成分、運輸和傳遞、遞質受體、離子內外流、神經組織結構、細胞分布；
 

　　6.微生物學和寄生蟲學：細菌、寄生蟲形態結構；
 

　　7.病理學及臨床應用：活檢標本診斷、腫瘤診斷、自身免疫性疾病診斷、HIV等；
 

　　8.遺傳學和組胚學：細胞生長、分化、成熟變化、細胞的三維結構、染色體分析、基因表達、基因診斷。